Wystawa Główna Muzeum Historii Żydów Polskich będzie składała się z ośmiu galerii, które na powierzchni ponad 4000 m²  zobrazują tysiącletnią historię największej społeczności żydowskiej na świecie osiadłej na ziemiach polskich. Wystawa pokaże tę obecność tak, jak jeszcze nigdzie i nigdy nie była ona prezentowana. Zamiast eksponatów widzowie zobaczą interaktywną opowieść o historii, kulturze i religii żydowskiej opartą na licznych materiałach źródłowych. Historia tysiąca lat obecności żydowskiej na ziemiach polskich zostanie opowiedziana w ośmiu  galeriach: Las, Pierwsze Spotkania (średniowiecze), Paradisus Iudaeorum (XV–XVI w.), Miasteczko (XVII–XVIII w.), Wyzwania Nowoczesności (XIX w.), II Rzeczpospolita, Zagłada, Powojnie. Symbolicznym zakończeniem Wystawy będzie galeria o charakterze czasowym – Dziedzictwo.

Twórcami projektu jest międzynarodowy zespół naukowców i koordynatorów poszczególnych galerii, pracujących pod kierownictwem prof. Barbary Kirshenblatt-Gimblett. Projekt wystawienniczy przygotowała brytyjska firma Event Communications, specjalizująca się w projektowaniu narracyjnych, multimedialnych ekspozycji w całej Europie. Od września 2011 roku, prace projektowe i produkcyjne prowadzone są przez polską firmę Nizio Design.

Sfinansowanie oraz realizacja projektowania i produkcji Wystawy Głównej jest odpowiedzialnością Stowarzyszenia Żydowski Instytut Historyczny.